Structural Bioinformatics and Molecular Modeling
CRBM-CNRS Montpellier

Details of the profile FBOX

Profile
Accession Number PS50181
Filename prosite-f-box.prf
Author Hofmann
Theme protein domains
Category Protein domains
Validated Yes
Description
Full profile
ID   FBOX; MATRIX.
AC   PS50181;
DT   DEC-2001 (CREATED); DEC-2001 (DATA UPDATE); DEC-2001 (INFO UPDATE).
DE   F-box domain profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=47;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=5; N2=43;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=.8338; R2=.02649440; TEXT='-LogE';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=289; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=213; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-80; E1=-50; MM=1; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='P'; M=-3,-10,-20,-11,-6,-16,-13,-14,-10,-10,-15,-10,-6,4,-9,-10,1,-2,-9,-28,-16,-9;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-14,-17,-16,-13,16,-24,-14,-4,-14,2,1,-12,-21,-17,-9,-12,-7,-1,-16,2,-14;
MA   /M: SY='N'; M=-7,-3,-23,-5,-3,-11,-12,-6,-13,-6,-14,-8,2,-8,-4,-4,1,-1,-13,-25,-9,-4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-22,-32,-23,12,-30,-21,20,-25,28,14,-25,-27,-21,-20,-23,-10,13,-10,4,-22;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-7,-20,-8,-5,-12,-12,-8,-8,-11,-1,-2,-5,-18,-6,-9,0,2,-6,-27,-9,-6;
MA   /M: SY='N'; M=-6,7,-21,5,4,-22,-11,-3,-19,4,-19,-11,9,-15,6,3,3,-2,-17,-29,-14,4;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-19,-31,-22,10,-30,-20,21,-27,41,21,-29,-29,-20,-20,-26,-9,15,-20,0,-21;
MA   /M: SY='P'; M=-10,-20,-39,-10,0,-30,-20,-20,-20,-10,-30,-20,-19,88,-10,-20,-9,-9,-30,-30,-30,-10;
MA   /M: SY='D'; M=-8,3,-24,4,2,-14,-16,-4,-14,-7,-14,-11,2,-7,-2,-9,2,0,-14,-26,-7,-1;
MA   /M: SY='E'; M=-10,2,-27,7,22,-23,-19,-1,-21,8,-14,-11,-2,-9,6,4,-5,-7,-18,-28,-13,14;
MA   /M: SY='I'; M=2,-24,-17,-27,-21,-4,-26,-24,20,-22,14,9,-21,-19,-19,-22,-12,-5,20,-25,-8,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-24,-22,-26,-17,4,-26,-14,11,-22,23,12,-21,-25,-13,-15,-19,-7,4,-12,2,-15;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-6,-20,-7,0,-11,-20,-4,-14,1,-9,-5,-4,-18,1,6,-7,-7,-13,-21,-4,0;
MA   /M: SY='K'; M=-12,-1,-22,-1,5,-23,-19,1,-21,13,-19,-9,1,-9,7,10,-7,-10,-19,-25,-9,4;
MA   /M: SY='I'; M=-6,-27,-22,-33,-27,1,-33,-28,35,-25,16,14,-21,-22,-21,-24,-14,-3,29,-23,-3,-27;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-28,-19,-32,-23,27,-29,-20,14,-27,29,13,-24,-28,-25,-20,-22,-7,10,-12,8,-23;
MA   /M: SY='Q'; M=-5,2,-20,2,5,-20,-13,-6,-20,5,-19,-12,3,-14,6,3,4,-2,-17,-24,-10,5;
MA   /M: SY='Y'; M=-15,-8,-23,-13,-9,1,-20,13,-12,-4,-10,-3,-2,-22,-3,0,-10,-8,-15,-7,16,-8;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-27,-11,-30,-22,7,-28,-19,17,-26,33,18,-27,-28,-20,-20,-23,-9,13,-21,-1,-21;
MA   /M: SY='D'; M=-9,16,-24,22,6,-28,-11,-8,-26,-1,-27,-21,9,7,-2,-8,6,1,-22,-35,-20,1;
MA   /M: SY='P'; M=-2,-16,-21,-17,-10,-10,-21,-15,-3,-12,-7,-3,-14,8,-8,-15,-4,-1,-5,-22,-8,-11;
MA   /M: M=-9,-4,-23,-5,-1,-16,-18,-8,-12,0,-14,-6,-3,-5,-1,-4,-5,-4,-12,-22,-9,-2;
MA   /M: SY='D'; M=-8,23,-24,31,18,-30,-11,0,-28,0,-24,-20,12,-10,7,-6,7,-2,-23,-34,-16,12;
MA   /M: SY='L'; M=-11,-24,-20,-27,-19,5,-30,-19,16,-21,28,13,-22,-26,-16,-14,-22,-7,9,-20,0,-19;
MA   /M: SY='F'; M=-10,-22,-10,-27,-21,15,-26,-15,4,-20,11,4,-17,-25,-20,-14,-17,-8,2,-15,5,-20;
MA   /I: I=-8; MI=-8; MD=-15; IM=-8; DM=-15;
MA   /M: SY='R'; M=-5,2,-22,-1,3,-19,-13,-5,-18,7,-20,-11,8,-15,2,10,5,2,-13,-28,-13,2;
MA   /M: SY='L'; M=-3,-25,-8,-30,-21,6,-27,-21,14,-25,22,10,-22,-26,-20,-21,-17,-6,10,-21,-2,-21;
MA   /M: SY='S'; M=2,-6,-11,-7,2,-19,-12,-10,-18,-2,-17,-11,-2,-13,0,2,10,4,-10,-30,-16,0;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-11,-22,-12,-3,-8,-20,-9,-9,-3,2,0,-10,-19,2,2,-11,-8,-10,-19,-3,-1;
MA   /M: SY='V'; M=0,-23,1,-26,-24,-4,-26,-26,14,-20,4,3,-21,-24,-24,-20,-7,2,26,-29,-11,-25;
MA   /M: SY='C'; M=-1,-4,26,-10,-12,-15,-13,-13,-21,-16,-23,-17,4,-18,-12,-16,12,3,-12,-39,-20,-12;
MA   /M: SY='R'; M=-9,-6,-25,-7,1,-21,-18,-2,-20,16,-17,-6,-3,-11,6,18,-4,-2,-15,-24,-9,2;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='R'; M=-10,-2,-25,-4,6,-21,-17,-1,-21,17,-16,-7,2,-14,9,23,-5,-6,-17,-23,-10,6; D=-4;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='W'; M=-10,-23,-22,-27,-20,15,-22,-18,-1,-18,4,0,-20,-22,-18,-13,-17,-7,-4,19,9,-18; D=-4;
MA   /I: MD=-15;
MA   /M: SY='R'; M=-8,0,-21,-4,-1,-13,-15,2,-17,10,-17,-9,6,-16,2,12,-3,-4,-16,-18,1,-1; D=-4;
MA   /I: I=-8; MI=-8; IM=-8; DM=-15;
MA   /M: SY='N'; M=-4,2,-18,0,0,-21,-10,-8,-17,-2,-16,-9,3,-14,1,-1,3,1,-13,-28,-14,0;
MA   /M: SY='I'; M=-4,-26,-20,-30,-23,3,-28,-22,23,-24,23,12,-23,-25,-19,-21,-17,-5,19,-20,0,-22;
MA   /M: SY='I'; M=-2,-22,-19,-27,-20,-3,-26,-20,18,-19,9,8,-18,-20,-17,-16,-12,-6,17,-23,-6,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-9,6,-25,7,7,-18,-16,-2,-19,5,-17,-10,5,-10,1,2,-1,-4,-17,-27,-10,3;
MA   /I: MD=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-6,9,-19,11,5,-21,-10,-2,-22,3,-20,-13,7,-10,2,2,5,0,-17,-26,-11,3; D=-3;
MA   /I: I=-5; MI=0; MD=-17; IM=0; DM=-17;
MA   /M: SY='D'; M=-8,11,-20,13,2,-18,-7,-1,-20,-4,-17,-14,8,-13,-4,-7,1,-3,-16,-27,-11,-1; D=-3;
MA   /I: DM=-17;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-4,-23,-4,3,-15,-17,-5,-13,-2,-9,-6,-2,-12,1,0,-2,-3,-12,-25,-9,1;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-12,-18,-16,-14,1,-22,-8,0,-11,3,2,-9,-22,-13,-10,-8,-2,2,-21,0,-14;
MA   /M: SY='W'; M=-15,-28,-32,-32,-26,27,-22,-16,-3,-20,-2,-4,-24,-28,-23,-18,-24,-16,-9,49,29,-22;
MA   /M: SY='R'; M=-8,-5,-25,-5,1,-20,-21,-6,-12,9,-12,-5,-4,-15,5,10,-5,-5,-9,-24,-9,2;
MA   /M: SY='R'; M=-10,0,-24,0,2,-20,-15,-4,-19,8,-19,-10,2,-10,2,9,-2,-3,-15,-26,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-16,-21,-20,-14,-1,-24,-10,7,-14,12,10,-14,-22,-11,-8,-14,-6,5,-21,-1,-14;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=40.7,103373;
NR   /TOTAL=51(51); /POSITIVE=50(50); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=1(1);
NR   /FALSE_NEG=2; /PARTIAL=0;
CC   /TAXO-RANGE=??E?V; /MAX-REPEAT=1;
CC   /STATUS=released;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /SCALING_DB=reversed;
CC   /FT_KEY=DOMAIN; /FT_DESC=F-BOX;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann;
DR   P53699, CC4_CANAL , T; P07834, CC4_YEAST , T; P41002, CG2F_HUMAN, T;
DR   P51944, CG2F_MOUSE, T; Q9NRD0, FBS_HUMAN , T; Q9UKT8, FBW2_HUMAN, T;
DR   Q60584, FBW2_MOUSE, T; P57775, FBW4_HUMAN, T; Q9JMJ2, FBW4_MOUSE, T;
DR   Q9UK22, FBX2_HUMAN, T; Q9UK99, FBX3_HUMAN, T; Q9UKT5, FBX4_HUMAN, T;
DR   Q9Y3I1, FBX7_HUMAN, T; Q9UK97, FBX9_HUMAN, T; Q9Y297, FW1A_HUMAN, T;
DR   Q9UKB1, FW1B_HUMAN, T; Q9UK96, FX10_HUMAN, T; O75426, FX24_HUMAN, T;
DR   Q9H4M3, FX30_HUMAN, T; P24814, GRR1_YEAST, T; P39014, MT30_YEAST, T;
DR   P87053, POF1_SCHPO, T; O74991, POF3_SCHPO, T; Q09855, POFB_SCHPO, T;
DR   P87060, POP1_SCHPO, T; O14170, POP2_SCHPO, T; Q01277, SCO2_NEUCR, T;
DR   Q00659, SCOB_EMENI, T; Q93794, SE10_CAEEL, T; Q23467, TBX7_CAEEL, T;
DR   Q91854, TRCB_XENLA, T; Q9J5H5, V026_FOWPV, T; P21076, VB18_VACCC, T;
DR   Q01222, VB18_VACCV, T; P33824, VB18_VARV , T; P41422, Y012_NPVAC, T;
DR   P47005, YJO9_YEAST, T; P34284, YKK7_CAEEL, T; P34293, YKO5_CAEEL, T;
DR   P46500, YLX4_CAEEL, T; P34459, YMD5_CAEEL, T; Q04511, YMI8_YEAST, T;
DR   P34483, YMJ8_CAEEL, T; P34484, YMJ9_CAEEL, T; P42843, YN51_YEAST, T;
DR   P53861, YNX0_YEAST, T; Q09336, YOF9_CAEEL, T; Q18262, YPI7_CAEEL, T;
DR   Q09299, YQOA_CAEEL, T; Q09990, YSS1_CAEEL, T;
DR   Q9UKB7, FBW3_HUMAN, N; O13795, POF8_SCHPO, N;
DR   O66891, FLIG_AQUAE, F;
DO   PDOC50181;
CC   Alignment not available
//