Structural Bioinformatics and Molecular Modeling
CRBM-CNRS Montpellier

Details of the profile LRR-GL

Profile
Accession Number AK00205
Filename new-plant-lrr.prf
Author
Theme Leucine Rich Repeat
Category Repeats
Validated Yes
Description
Full profile
ID   LRR-GL; MATRIX.
AC   AK00205;
DT   Thu Jul 06 17:10:47 2006
DE   Profile spans three repeats
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=72;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=67;
CC   Automatic scaling using big reversed database;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=3.7162; R2=0.00907730; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=527; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=306; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: M0=-9; D=-20; I=-20; B0=*; B1=*; E0=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B0=0; B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='E'; M=5,1,-23,4,23,-27,3,-9,-27,-2,-22,-18,0,-7,4,-9,8,-5,-22,-28,-22,14;
MA   /M: SY='G'; M=-8,0,-28,5,-1,-27,7,-10,-31,-1,-28,-19,2,2,-4,6,3,-7,-24,-29,-22,-5;
MA   /M: SY='C'; M=-8,-10,49,-18,-18,-16,-25,-5,-23,-20,-16,-13,-8,-26,-16,-18,1,10,-10,-40,-15,-18;
MA   /M: SY='P'; M=4,-6,-28,-4,11,-28,-15,-13,-23,15,-24,-14,-7,16,2,1,-4,-8,-19,-24,-19,5;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-23,-15,-23,-20,-7,-28,-25,15,-3,0,5,-23,-25,-20,-8,-10,-2,33,-28,-10,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-2,-7,-15,-17,-15,-8,-25,-22,5,-15,-3,-3,-5,-12,-12,-15,10,35,7,-28,-8,-15;
MA   /M: SY='D'; M=0,12,-25,17,1,-29,5,16,-31,-9,-23,-16,7,-14,-4,-12,0,-12,-23,-29,-12,-3;
MA   /M: SY='A'; M=28,-8,-15,-16,-12,-21,13,-20,-17,-12,-15,-12,-6,-12,-12,-18,9,4,-7,-22,-21,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-2,-12,5,-15,-22,-28,47,-22,-38,-22,-28,-20,-5,-25,-22,-22,-2,-18,-25,-27,-30,-22;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-5,-25,-3,14,-24,-22,-9,-14,17,-16,-6,-7,-13,11,7,-6,-8,-7,-25,-12,12;
MA   /M: SY='E'; M=-10,-2,-25,3,24,-21,-22,17,-16,-2,-13,-8,-5,-12,6,-5,-5,-10,-11,-30,-8,14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-22,-32,-22,8,-32,-22,27,-30,43,20,-28,-28,-20,-22,-28,-10,15,-20,0,-22;
MA   /M: SY='T'; M=2,0,-15,-4,-1,-19,-12,-14,-19,5,-23,-14,4,-10,-1,0,21,23,-9,-32,-14,-1;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='A'; M=33,-10,-15,-18,-8,-20,-5,-15,-15,0,-12,-10,-8,-12,-5,2,5,-2,-5,-20,-18,-8;
MA   /M: SY='N'; M=-5,21,-20,10,2,-22,-5,0,-22,10,-30,-18,34,-15,2,5,12,2,-23,-35,-18,2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=6,-6,-15,-9,2,-14,-19,-17,-5,-7,-8,-8,-9,-12,-7,-12,6,15,4,-28,-14,-2;
MA   /M: SY='E'; M=-3,-5,-21,-4,8,-17,-15,-11,-15,3,-10,-8,-3,-13,1,-1,5,1,-11,-29,-13,4;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-14,34,-24,25,3,-23,-5,25,-25,-2,-28,-18,44,-18,2,-2,5,-5,-30,-38,-13,2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='R'; M=-11,-3,-25,0,15,-22,-15,-2,-28,16,-22,-15,2,-13,10,34,4,-3,-20,-27,-15,10;
MA   /M: SY='R'; M=-18,-20,-25,-24,-14,19,-25,-10,-11,-1,3,-1,-12,-25,-12,23,-17,-10,-8,-10,5,-14;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-10,52,-20,-20,-15,-25,-25,-20,-20,-15,-15,-10,-24,-20,-20,6,21,-5,-40,-20,-20;
MA   /M: SY='P'; M=4,-9,-29,-9,-3,-28,5,-17,-26,8,-26,-15,-7,12,-6,-3,-4,-10,-21,-22,-21,-6;
MA   /M: SY='V'; M=-2,-23,-15,-23,-20,-7,-28,-25,15,-3,0,5,-23,-25,-20,-8,-10,-2,33,-28,-10,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-7,-12,-20,-20,-17,2,-27,-13,7,-15,0,0,-10,-17,-12,-15,1,21,5,-13,14,-17;
MA   /M: SY='D'; M=-20,26,-30,38,9,-24,-16,28,-31,-4,-23,-18,11,-16,1,-8,-6,-12,-27,-26,6,3;
MA   /M: SY='A'; M=14,-9,-21,-10,2,-20,7,-15,-17,-11,-7,-10,-8,-13,-7,-15,-1,-9,-13,-22,-19,-2;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-28,13,-30,-22,3,-30,-22,8,-30,34,11,-28,-32,-22,-22,-25,-10,5,-27,-7,-22;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-5,-25,-3,14,-24,-22,-9,-14,17,-16,-6,-7,-13,11,7,-6,-8,-7,-25,-12,12;
MA   /M: SY='H'; M=-15,4,-30,7,23,-25,-20,46,-30,7,-22,-9,5,-11,14,5,-6,-15,-28,-28,1,16;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-6,2,-26,5,20,-28,-16,-8,-28,29,-28,-14,2,-8,10,15,2,-4,-20,-26,-14,15;
MA   /M: SY='G'; M=0,-10,-30,-10,-20,-30,70,-20,-40,-20,-30,-20,0,-20,-20,-20,0,-20,-30,-20,-30,-20;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=6,-11,-15,-15,-11,-14,-15,-16,-7,-3,-11,-7,-7,-17,-8,5,7,9,5,-27,-14,-11;
MA   /M: SY='N'; M=-10,21,-25,10,5,-25,-10,0,-25,24,-30,-15,31,-15,5,14,0,-5,-25,-30,-15,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=4,1,-20,-2,12,-21,-17,-13,-20,9,-17,-12,-2,-8,2,0,6,13,-12,-26,-14,7;
MA   /M: SY='V'; M=1,-12,-15,-12,-10,-14,-17,-18,-2,1,-14,-5,-9,-18,-10,-4,8,5,12,-31,-14,-10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='D'; M=-15,45,-25,46,10,-30,-5,5,-30,0,-30,-25,39,-15,0,-5,5,-5,-30,-40,-20,5;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='F'; M=-13,-16,-25,-18,-6,27,-4,-15,-17,-18,-7,-10,-10,-20,-21,-15,-10,-12,-14,-7,4,-11;
MA   /M: SY='G'; M=-10,-15,-28,-17,-17,-2,24,-15,-28,-10,-18,-13,-5,-22,-17,2,-7,-15,-21,-13,-11,-17;
MA   /M: SY='T'; M=-5,5,19,-8,-13,-15,-18,-15,-17,-13,-17,-15,9,-20,-13,-13,10,24,-9,-37,-17,-13;
MA   /M: SY='P'; M=-6,-13,-28,-9,-5,-13,-16,-7,-15,-10,-23,-15,-10,28,-7,-14,4,0,-19,-19,-1,-9;
MA   /M: SY='V'; M=-5,-18,-20,-22,-17,-9,-28,-23,13,-4,-1,4,-15,-19,-15,-8,-7,3,20,-25,-8,-17;
MA   /M: SY='T'; M=-1,-7,-15,-15,-13,-9,-21,-21,3,-15,-6,-5,-3,-12,-11,-15,14,30,5,-29,-9,-13;
MA   /M: SY='D'; M=-20,38,-30,53,15,-35,-12,24,-38,-2,-28,-23,18,-12,2,-8,-2,-12,-30,-38,-10,8;
MA   /M: SY='A'; M=28,-8,-15,-16,-12,-21,13,-20,-17,-12,-15,-12,-6,-12,-12,-18,9,4,-7,-22,-21,-12;
MA   /M: SY='G'; M=-4,1,9,2,-12,-28,20,-17,-34,-17,-28,-22,1,-21,-15,-19,4,-9,-22,-34,-26,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='V'; M=5,-16,-17,-18,-12,-14,-22,-21,2,7,-8,0,-16,-20,-12,-2,-7,-4,17,-25,-12,-12;
MA   /M: SY='H'; M=-15,5,-30,10,31,-25,-20,48,-30,0,-20,-10,5,-10,15,0,-5,-15,-30,-30,-1,21;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='K'; M=-8,-2,-30,-2,5,-30,-5,-12,-32,38,-30,-12,0,-12,5,22,-8,-12,-22,-20,-13,5;
MA   /M: SY='G'; M=-8,-3,-30,-1,8,-28,17,-10,-34,9,-26,-16,0,-13,0,9,-4,-14,-26,-22,-21,3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='T'; M=-4,-9,-20,-13,-9,-14,-18,-14,-4,-5,-13,-7,-1,-15,-4,5,10,11,-1,-29,-11,-9;
MA   /M: SY='K'; M=-10,16,-26,8,6,-26,-12,-2,-26,30,-30,-14,24,-14,6,18,-2,-6,-24,-28,-14,6;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='E'; M=-5,5,-20,4,24,-20,-20,-10,-20,0,-15,-15,0,-5,4,-5,10,21,-14,-30,-15,14;
MA   /M: SY='C'; M=-5,-8,12,-9,0,-21,-20,-16,-18,2,-19,-12,-8,-19,-6,-5,1,-3,-6,-34,-18,-3;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /M: SY='N'; M=-14,32,-24,23,3,-23,-5,6,-25,6,-28,-20,42,-18,2,11,5,-4,-28,-36,-18,2;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-30,-20,10,-30,-20,20,-30,50,20,-30,-30,-20,-20,-30,-10,10,-20,0,-20;
MA   /I: E0=0; E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /GENERATED_BY="pfmake -1 new-plant-lrr.msf blosum45.cmp";
//