Structural Bioinformatics and Molecular Modeling
CRBM-CNRS Montpellier

Details of the profile HEAT_REPEAT

Profile
Accession Number PS50077
Filename heat-swiss.prf
Author Hofmann
Theme Alpha-solenoids
Category Repeats
Validated Yes
Description
Full profile
ID   HEAT_REPEAT; MATRIX.
AC   PS50077;
DT   OCT-2001 (CREATED); OCT-2001 (DATA UPDATE); OCT-2001 (INFO UPDATE).
DE   spans one HEAT repeat 
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=39;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=4; N2=36;
CC   Automatic scaling using small shuffled database;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=2.0508; R2=0.02450323; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=263; N_SCORE=8.5; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=181; N_SCORE=6.5; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=-100; E1=-100; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-29,-20,-32,-23,6,-31,-24,25,-27,30,16,-26,-23,-21,-23,-22,-8,18,-21,-2,-23;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-23,-20,-26,-18,0,-27,-18,17,-18,21,14,-21,-25,-16,-12,-19,-8,13,-23,-4,-18;
MA   /M: SY='P'; M=-4,-11,-33,-5,2,-28,-16,-16,-20,-8,-27,-19,-11,58,-5,-16,-3,-6,-25,-30,-26,-5;
MA   /M: SY='V'; M=-1,-16,-12,-20,-12,-4,-21,-15,1,-14,0,1,-14,-13,-12,-15,-6,-2,3,-23,-7,-13;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-28,-16,-32,-25,15,-31,-21,20,-26,24,13,-25,-28,-23,-21,-20,-7,17,-16,5,-24;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-15,-20,-16,-7,-8,-23,-15,4,-10,5,3,-13,-19,-7,-7,-8,-2,4,-24,-7,-8;
MA   /M: SY='E'; M=-7,9,-23,10,14,-25,-14,-2,-22,5,-21,-14,8,-10,8,2,3,-2,-19,-30,-15,10;
MA   /M: SY='L'; M=-6,-19,-13,-22,-14,0,-21,-13,4,-20,18,9,-18,-24,-13,-16,-16,-6,0,-18,-3,-14;
MA   /M: SY='L'; M=4,-18,-7,-23,-17,-5,-18,-17,5,-20,10,6,-15,-21,-14,-18,-6,-1,6,-26,-9,-16;
MA   /I: I=-8; MI=-20; MD=-25; IM=-20;
MA   /M: SY='K'; M=-7,1,-25,-1,5,-22,-7,-7,-22,8,-21,-11,4,-13,7,7,1,-2,-19,-19,-13,6; D=-6;
MA   /I: DM=-25;
MA   /M: SY='D'; M=-18,43,-28,57,15,-34,-11,1,-34,-1,-27,-26,20,-12,-1,-8,0,-9,-26,-38,-17,6;
MA   /M: SY='E'; M=-8,7,-25,12,15,-28,-14,-6,-26,6,-24,-17,3,5,5,0,2,-3,-23,-30,-18,9;
MA   /M: SY='D'; M=-8,11,-21,13,9,-22,-14,-2,-19,-1,-19,-13,7,-14,2,-5,4,-2,-13,-31,-14,5;
MA   /M: SY='P'; M=-7,-9,-29,-7,-4,-15,-17,-11,-13,-7,-15,-11,-11,4,-6,-11,-8,-6,-13,-7,-5,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-9,4,-22,6,10,-20,-17,-2,-17,-1,-12,-8,2,-12,3,1,-1,-4,-15,-29,-12,6;
MA   /I: I=-10; MI=-5; IM=-5;
MA   /M: SY='V'; M=-4,-27,-15,-28,-27,0,-30,-22,27,-21,11,10,-25,-28,-25,-20,-12,-3,38,-26,-4,-27;
MA   /M: SY='R'; M=-17,-9,-29,-9,2,-21,-21,-2,-27,29,-19,-8,-1,-18,11,55,-10,-10,-19,-20,-9,3;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-9,-22,-10,-3,-2,-20,-4,-6,-8,2,2,-10,-19,-6,-5,-10,-7,-7,-18,2,-5;
MA   /M: SY='A'; M=14,-5,-16,-13,-8,-10,-10,-13,-8,-7,-8,-4,-1,-15,-7,-11,3,2,-4,-23,-12,-7;
MA   /M: SY='A'; M=21,-16,-9,-23,-16,-10,-14,-22,3,-16,1,-1,-14,-17,-15,-19,2,3,10,-24,-13,-16;
MA   /M: SY='A'; M=16,-14,-14,-20,-13,-11,-14,-19,2,-13,0,-1,-13,-17,-12,-16,-2,-2,7,-23,-12,-13;
MA   /M: SY='E'; M=-5,3,-25,4,15,-21,-14,-3,-23,8,-20,-12,2,-11,9,3,1,-5,-20,-20,-11,12;
MA   /M: SY='A'; M=8,-5,-9,-10,-6,-18,-8,-12,-15,-2,-16,-10,-1,-16,-3,-5,6,2,-8,-27,-14,-5;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-27,-15,-31,-23,8,-30,-19,20,-25,30,18,-25,-27,-20,-20,-22,-8,14,-20,1,-22;
MA   /M: SY='S'; M=-1,-4,-20,-6,-7,-21,2,-11,-17,-6,-18,-9,0,-10,-4,-8,3,-3,-14,-26,-16,-6;
MA   /M: SY='E'; M=-1,-4,-19,-5,1,-18,-11,-12,-16,1,-14,-10,-2,-13,-3,0,1,-1,-10,-26,-14,-1;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-29,-20,-34,-25,17,-32,-23,25,-28,27,15,-24,-26,-24,-23,-21,-9,17,-16,4,-25;
MA   /M: SY='A'; M=12,-11,-5,-17,-13,-15,-7,-18,-6,-14,-8,-5,-8,-18,-10,-17,3,0,0,-27,-16,-12;
MA   /M: SY='E'; M=-6,-1,-27,1,12,-23,-15,-8,-20,6,-17,-12,-3,2,5,1,-2,-4,-19,-26,-15,7;
MA   /M: SY='V'; M=2,-14,-20,-19,-12,-5,-19,-14,4,-14,3,1,-12,-19,-10,-13,-7,-4,5,-20,-6,-12;
MA   /I: E1=-90;
MA   /M: SY='L'; M=-7,-26,-16,-30,-22,7,-29,-19,18,-24,23,14,-24,-24,-21,-20,-19,-6,16,-21,-2,-22;
MA   /I: E1=-80;
MA   /M: SY='G'; M=-3,1,-26,2,-2,-25,21,-12,-28,-9,-23,-16,4,-11,-8,-11,3,-7,-22,-27,-22,-5;
MA   /I: E1=-70;
MA   /M: SY='E'; M=-4,-3,-26,-2,4,-23,-8,-9,-18,-1,-20,-11,-2,4,2,-6,1,-4,-17,-27,-16,2;
MA   /I: E1=-60;
MA   /M: SY='E'; M=-6,9,-25,14,19,-25,-14,-6,-23,2,-21,-16,4,-3,6,-4,3,-3,-20,-30,-16,12;
MA   /I: E1=-50;
MA   /M: M=-5,-3,-22,-4,-3,-15,-18,-8,-10,-6,-10,-6,-4,-14,0,-6,-4,-6,-9,-20,-9,-2;
MA   /I: E1=-40;
MA   /M: SY='V'; M=-3,-16,-13,-21,-18,2,-23,-19,6,-18,8,4,-15,-22,-17,-15,-7,6,9,-22,-3,-18;
MA   /I: E1=-30;
MA   /M: SY='E'; M=-7,-1,-22,-1,5,-20,-19,-9,-14,4,-13,-8,-3,-11,1,2,-4,-5,-10,-26,-12,2;
MA   /I: E1=-20;
MA   /M: SY='E'; M=-3,4,-23,2,6,-22,-11,-4,-20,5,-21,-12,5,-9,5,1,5,1,-17,-27,-12,5;
MA   /I: E1=-10;
MA   /M: SY='H'; M=-11,-4,-25,-3,3,-9,-21,5,-10,-7,-4,-3,-4,-17,-1,-7,-8,-7,-11,-22,0,0;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
NR   /RELEASE=39,87397;
NR   /TOTAL=109(29); /POSITIVE=108(28); /UNKNOWN=0(0); /FALSE_POS=1(1);
NR   /FALSE_NEG=0; /PARTIAL=0;
CC   /TAXO-RANGE=??E??; /MAX-REPEAT=12;
CC   /FT_KEY=REPEAT; /FT_DESC=HEAT;
CC   /AUTHOR=K_Hofmann;
DR   Q09543, 2AAA_CAEEL, T; P36179, 2AAA_DROME, T; P30153, 2AAA_HUMAN, T; 
DR   P36875, 2AAA_PEA  , T; P54612, 2AAA_PIG  , T; P31383, 2AAA_YEAST, T; 
DR   P30154, 2AAB_HUMAN, T; P54613, 2AAB_PIG  , T; Q14008, CTOG_HUMAN, T; 
DR   P16521, EF3A_YEAST, T; P53978, EF3B_YEAST, T; P25997, EF3_CANAL , T; 
DR   P29551, EF3_PNECA , T; P33892, GCN1_YEAST, T; P51112, HD_FUGRU  , T; 
DR   Q14974, IMB1_HUMAN, T; P70168, IMB1_MOUSE, T; P52296, IMB1_RAT  , T; 
DR   O13864, IMB1_SCHPO, T; Q06142, IMB1_YEAST, T; O60100, IMB4_SCHPO, T; 
DR   P40069, IMB4_YEAST, T; O18388, IMB_DROME , T; P46675, STU2_YEAST, T; 
DR   P22219, VP15_YEAST, T; Q10105, YAQ5_SCHPO, T; P42945, YJK9_YEAST, T; 
DR   Q06708, YL86_YEAST, T; 
DR   Q51334, DPOL_PYRSD, F; 
3D   1B3U; 
DO   PDOC50077;
//