Structural Bioinformatics and Molecular Modeling
CRBM-CNRS Montpellier

Details of the profile LRR_RI

Profile
Accession Number PS50503
Filename lrr_ri.prf
Author Andrey Kajava
Theme Leucine Rich Repeat
Category Repeats
Validated Yes
Description
Ribonuclease inhibitor-like LRR subfamily profile (Kajava A.V. J.Mol.Biol. 1998, 277:519)
Full profile
ID   LRR_RI; MATRIX.
AC   PS50503;
DT   OCT-2001 (CREATED); OCT-2001 (DATA UPDATE); OCT-2001 (INFO UPDATE).
DE   Ribonuclease inhibitor-like LRR profile.
MA   /GENERAL_SPEC: ALPHABET='ABCDEFGHIKLMNPQRSTVWYZ'; LENGTH=84;
MA   /DISJOINT: DEFINITION=PROTECT; N1=6; N2=79;
CC   Automatic scaling using big reversed database;
MA   /NORMALIZATION: MODE=1; FUNCTION=LINEAR; R1=1.7865; R2=0.02539614; TEXT='NScore';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=0; SCORE=550; N_SCORE=15.8; MODE=1; TEXT='!';
MA   /CUT_OFF: LEVEL=-1; SCORE=200; N_SCORE=6.9; MODE=1; TEXT='?';
MA   /DEFAULT: D=-20; I=-20; B1=*; E1=*; MI=-105; MD=-105; IM=-105; DM=-105; M0=-9;
MA   /I: B1=0; BI=-105; BD=-105;
MA   /M: SY='S'; M=5,-3,-22,-5,1,-21,2,-10,-22,-4,-23,-15,1,-9,1,-6,10,0,-18,-21,-15,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,7,-16,5,-2,-14,-9,0,-20,-6,-16,-12,9,-19,-2,-3,0,-5,-19,-26,-6,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-9,17,24,2,-11,-21,-5,-5,-24,-11,-27,-20,29,-26,-11,-11,4,-4,-23,-42,-24,-11;
MA   /M: M=-8,-4,-6,-4,-1,-22,-9,-7,-24,-1,-18,-13,-2,-12,-4,-2,-2,-5,-18,-30,-16,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-21,-35,-27,15,-33,-25,29,-28,26,15,-25,-27,-25,-23,-21,-8,23,-18,2,-27;
MA   /M: SY='S'; M=-3,3,-15,0,0,-22,3,-12,-24,-5,-22,-16,6,-13,-4,-6,12,10,-17,-30,-19,-2;
MA   /M: SY='D'; M=0,17,-24,22,11,-30,-2,-2,-29,-2,-24,-19,9,-11,2,-7,5,-6,-22,-31,-18,6;
MA   /M: SY='A'; M=6,2,-24,6,4,-25,-13,-13,-19,1,-18,-15,-4,4,-4,-8,-1,-6,-12,-28,-19,-1;
MA   /M: SY='G'; M=1,-6,-19,-8,-14,-28,41,-16,-33,-14,-27,-18,2,-19,-11,-15,4,-11,-25,-24,-26,-13;
MA   /M: SY='A'; M=21,-16,16,-24,-19,-17,-7,-23,-9,-18,-8,-7,-14,-20,-17,-23,-1,-5,1,-27,-20,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-9,-22,-11,-1,-12,-15,-9,-14,1,-10,-6,-6,-17,2,8,-1,0,-9,-21,-8,0;
MA   /M: SY='A'; M=8,-6,-22,-6,1,-21,-14,-7,-11,-7,-11,-7,-7,-3,2,-11,1,-4,-9,-26,-14,0;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-21,-29,-20,9,-29,-20,18,-23,36,18,-26,-27,-18,-17,-25,-9,10,-19,0,-19;
MA   /M: SY='A'; M=22,-15,16,-22,-16,-15,-12,-22,-8,-18,-6,-8,-13,-20,-15,-21,3,-1,1,-29,-19,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-4,0,-25,4,18,-26,-12,1,-23,4,-20,-13,-1,-7,12,4,3,-6,-19,-28,-15,14;
MA   /M: SY='A'; M=11,-13,-16,-17,-15,-14,-1,-19,-6,-12,-9,-5,-9,-17,-13,-12,5,4,3,-25,-16,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-32,-23,13,-31,-21,24,-28,38,19,-27,-28,-22,-21,-26,-9,15,-18,2,-23;
MA   /M: SY='R'; M=2,-12,-22,-14,-4,-15,-14,-13,-13,1,-5,-6,-9,-10,-4,9,-5,-4,-9,-23,-13,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-3,6,-21,8,1,-23,-12,0,-18,-5,-17,-11,2,-14,2,-6,5,3,-11,-30,-12,1;
MA   /M: SY='N'; M=-5,1,-19,-5,-5,-19,-11,-5,-14,-2,-16,-8,8,-3,-5,-6,-3,-6,-16,-30,-15,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-10,-8,-11,-4,-22,-13,-13,-20,-3,-21,-14,-8,8,-7,-4,1,-2,-14,-29,-19,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-3,-14,-5,-1,-14,-16,-5,-16,-4,-14,-9,0,-15,2,-1,7,7,-11,-28,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-31,-22,12,-31,-21,22,-29,43,18,-29,-29,-22,-21,-27,-9,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-5,-27,-2,18,-21,-21,-5,-19,12,-11,-8,-5,-13,11,17,-7,-8,-16,-25,-12,13;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-4,-22,-1,17,-18,-21,-4,-13,1,-13,-9,-6,-12,3,-3,0,-2,-6,-28,-12,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-22,12,-31,-21,22,-29,42,20,-28,-29,-21,-21,-27,-10,13,-19,1,-21;
MA   /M: SY='B'; M=-8,16,-25,16,2,-23,-11,6,-24,-3,-23,-16,15,-16,2,-6,1,-5,-22,-17,-9,2;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-31,-23,11,-30,-20,23,-27,38,21,-28,-28,-21,-20,-26,-9,16,-20,0,-22;
MA   /M: SY='S'; M=5,-3,-22,-5,1,-21,2,-10,-22,-4,-23,-15,1,-9,1,-6,10,0,-18,-21,-15,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,7,-16,5,-2,-14,-9,0,-20,-6,-16,-12,9,-19,-2,-3,0,-5,-19,-26,-6,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-9,17,24,2,-11,-21,-5,-5,-24,-11,-27,-20,29,-26,-11,-11,4,-4,-23,-42,-24,-11;
MA   /M: M=-8,-4,-6,-4,-1,-22,-9,-7,-24,-1,-18,-13,-2,-12,-4,-2,-2,-5,-18,-30,-16,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-21,-35,-27,15,-33,-25,29,-28,26,15,-25,-27,-25,-23,-21,-8,23,-18,2,-27;
MA   /M: SY='S'; M=-3,3,-15,0,0,-22,3,-12,-24,-5,-22,-16,6,-13,-4,-6,12,10,-17,-30,-19,-2;
MA   /M: SY='D'; M=0,17,-24,22,11,-30,-2,-2,-29,-2,-24,-19,9,-11,2,-7,5,-6,-22,-31,-18,6;
MA   /M: SY='A'; M=6,2,-24,6,4,-25,-13,-13,-19,1,-18,-15,-4,4,-4,-8,-1,-6,-12,-28,-19,-1;
MA   /M: SY='G'; M=1,-6,-19,-8,-14,-28,41,-16,-33,-14,-27,-18,2,-19,-11,-15,4,-11,-25,-24,-26,-13;
MA   /M: SY='A'; M=21,-16,16,-24,-19,-17,-7,-23,-9,-18,-8,-7,-14,-20,-17,-23,-1,-5,1,-27,-20,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-9,-22,-11,-1,-12,-15,-9,-14,1,-10,-6,-6,-17,2,8,-1,0,-9,-21,-8,0;
MA   /M: SY='A'; M=8,-6,-22,-6,1,-21,-14,-7,-11,-7,-11,-7,-7,-3,2,-11,1,-4,-9,-26,-14,0;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-21,-29,-20,9,-29,-20,18,-23,36,18,-26,-27,-18,-17,-25,-9,10,-19,0,-19;
MA   /M: SY='A'; M=22,-15,16,-22,-16,-15,-12,-22,-8,-18,-6,-8,-13,-20,-15,-21,3,-1,1,-29,-19,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-4,0,-25,4,18,-26,-12,1,-23,4,-20,-13,-1,-7,12,4,3,-6,-19,-28,-15,14;
MA   /M: SY='A'; M=11,-13,-16,-17,-15,-14,-1,-19,-6,-12,-9,-5,-9,-17,-13,-12,5,4,3,-25,-16,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-32,-23,13,-31,-21,24,-28,38,19,-27,-28,-22,-21,-26,-9,15,-18,2,-23;
MA   /M: SY='R'; M=2,-12,-22,-14,-4,-15,-14,-13,-13,1,-5,-6,-9,-10,-4,9,-5,-4,-9,-23,-13,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-3,6,-21,8,1,-23,-12,0,-18,-5,-17,-11,2,-14,2,-6,5,3,-11,-30,-12,1;
MA   /M: SY='N'; M=-5,1,-19,-5,-5,-19,-11,-5,-14,-2,-16,-8,8,-3,-5,-6,-3,-6,-16,-30,-15,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-10,-8,-11,-4,-22,-13,-13,-20,-3,-21,-14,-8,8,-7,-4,1,-2,-14,-29,-19,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-3,-14,-5,-1,-14,-16,-5,-16,-4,-14,-9,0,-15,2,-1,7,7,-11,-28,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-31,-22,12,-31,-21,22,-29,43,18,-29,-29,-22,-21,-27,-9,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-5,-27,-2,18,-21,-21,-5,-19,12,-11,-8,-5,-13,11,17,-7,-8,-16,-25,-12,13;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-4,-22,-1,17,-18,-21,-4,-13,1,-13,-9,-6,-12,3,-3,0,-2,-6,-28,-12,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-22,12,-31,-21,22,-29,42,20,-28,-29,-21,-21,-27,-10,13,-19,1,-21;
MA   /M: SY='B'; M=-8,16,-25,16,2,-23,-11,6,-24,-3,-23,-16,15,-16,2,-6,1,-5,-22,-17,-9,2;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-31,-23,11,-30,-20,23,-27,38,21,-28,-28,-21,-20,-26,-9,16,-20,0,-22;
MA   /M: SY='S'; M=5,-3,-22,-5,1,-21,2,-10,-22,-4,-23,-15,1,-9,1,-6,10,0,-18,-21,-15,0;
MA   /M: SY='N'; M=-10,7,-16,5,-2,-14,-9,0,-20,-6,-16,-12,9,-19,-2,-3,0,-5,-19,-26,-6,-2;
MA   /M: SY='N'; M=-9,17,24,2,-11,-21,-5,-5,-24,-11,-27,-20,29,-26,-11,-11,4,-4,-23,-42,-24,-11;
MA   /M: M=-8,-4,-6,-4,-1,-22,-9,-7,-24,-1,-18,-13,-2,-12,-4,-2,-2,-5,-18,-30,-16,-3;
MA   /M: SY='I'; M=-9,-30,-21,-35,-27,15,-33,-25,29,-28,26,15,-25,-27,-25,-23,-21,-8,23,-18,2,-27;
MA   /M: SY='S'; M=-3,3,-15,0,0,-22,3,-12,-24,-5,-22,-16,6,-13,-4,-6,12,10,-17,-30,-19,-2;
MA   /M: SY='D'; M=0,17,-24,22,11,-30,-2,-2,-29,-2,-24,-19,9,-11,2,-7,5,-6,-22,-31,-18,6;
MA   /M: SY='A'; M=6,2,-24,6,4,-25,-13,-13,-19,1,-18,-15,-4,4,-4,-8,-1,-6,-12,-28,-19,-1;
MA   /M: SY='G'; M=1,-6,-19,-8,-14,-28,41,-16,-33,-14,-27,-18,2,-19,-11,-15,4,-11,-25,-24,-26,-13;
MA   /M: SY='A'; M=21,-16,16,-24,-19,-17,-7,-23,-9,-18,-8,-7,-14,-20,-17,-23,-1,-5,1,-27,-20,-18;
MA   /M: SY='R'; M=-6,-9,-22,-11,-1,-12,-15,-9,-14,1,-10,-6,-6,-17,2,8,-1,0,-9,-21,-8,0;
MA   /M: SY='A'; M=8,-6,-22,-6,1,-21,-14,-7,-11,-7,-11,-7,-7,-3,2,-11,1,-4,-9,-26,-14,0;
MA   /M: SY='L'; M=-8,-27,-21,-29,-20,9,-29,-20,18,-23,36,18,-26,-27,-18,-17,-25,-9,10,-19,0,-19;
MA   /M: SY='A'; M=22,-15,16,-22,-16,-15,-12,-22,-8,-18,-6,-8,-13,-20,-15,-21,3,-1,1,-29,-19,-16;
MA   /M: SY='E'; M=-4,0,-25,4,18,-26,-12,1,-23,4,-20,-13,-1,-7,12,4,3,-6,-19,-28,-15,14;
MA   /M: SY='A'; M=11,-13,-16,-17,-15,-14,-1,-19,-6,-12,-9,-5,-9,-17,-13,-12,5,4,3,-25,-16,-14;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-32,-23,13,-31,-21,24,-28,38,19,-27,-28,-22,-21,-26,-9,15,-18,2,-23;
MA   /M: SY='R'; M=2,-12,-22,-14,-4,-15,-14,-13,-13,1,-5,-6,-9,-10,-4,9,-5,-4,-9,-23,-13,-6;
MA   /M: SY='D'; M=-3,6,-21,8,1,-23,-12,0,-18,-5,-17,-11,2,-14,2,-6,5,3,-11,-30,-12,1;
MA   /M: SY='N'; M=-5,1,-19,-5,-5,-19,-11,-5,-14,-2,-16,-8,8,-3,-5,-6,-3,-6,-16,-30,-15,-6;
MA   /I: I=-6; MI=0; MD=-29; IM=0; DM=-29;
MA   /M: SY='P'; M=-1,-10,-8,-11,-4,-22,-13,-13,-20,-3,-21,-14,-8,8,-7,-4,1,-2,-14,-29,-19,-7; D=-6;
MA   /I: I=-6; MI=-29; IM=-29; DM=-29;
MA   /M: SY='S'; M=-4,-3,-14,-5,-1,-14,-16,-5,-16,-4,-14,-9,0,-15,2,-1,7,7,-11,-28,-10,0;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-20,-31,-22,12,-31,-21,22,-29,43,18,-29,-29,-22,-21,-27,-9,14,-20,0,-22;
MA   /M: SY='E'; M=-11,-5,-27,-2,18,-21,-21,-5,-19,12,-11,-8,-5,-13,11,17,-7,-8,-16,-25,-12,13;
MA   /M: SY='E'; M=-5,-4,-22,-1,17,-18,-21,-4,-13,1,-13,-9,-6,-12,3,-3,0,-2,-6,-28,-12,10;
MA   /M: SY='L'; M=-10,-30,-21,-31,-22,12,-31,-21,22,-29,42,20,-28,-29,-21,-21,-27,-10,13,-19,1,-21;
MA   /M: SY='B'; M=-8,16,-25,16,2,-23,-11,6,-24,-3,-23,-16,15,-16,2,-6,1,-5,-22,-17,-9,2;
MA   /M: SY='L'; M=-9,-29,-20,-31,-23,11,-30,-20,23,-27,38,21,-28,-28,-21,-20,-26,-9,16,-20,0,-22;
MA   /I: E1=0; IE=-105; DE=-105;
CC   /STATUS=submitted;
CC   /MATRIX_TYPE=protein_domain;
CC   /AUTHOR=A_Kajava;
DO   QDOC50500;
//